Badanie wykonuje się w pozycji siedzącej. Pacjent oddycha przez ustnik spirometru zgodnie z instrukcjami osoby wykonującej test. Najpierw oddycha spokojnie, następnie wykonuje maksymalny wdech i bardzo silny, szybki wydech.
Procedura powtarzana jest zazwyczaj kilkukrotnie, by uzyskać wiarygodny wynik. W niektórych przypadkach stosuje się tzw. próbę rozkurczową – po podaniu leku rozszerzającego oskrzela badanie jest wykonywane ponownie, by sprawdzić odwracalność obturacji.
Spirometria jest całkowicie bezpieczna, bezbolesna i wykonywana rutynowo również u dzieci czy seniorów. Może wiązać się z chwilowym uczuciem zmęczenia po silnym wydechu, ale nie powoduje żadnych trwałych dolegliwości. Jedynym przeciwwskazaniem do badania są stany ostre (np. świeżo przebyty zawał, udar, krwotok) lub zaburzenia uniemożliwiające wykonanie prawidłowego wysiłku oddechowego.